作者:翼鸟風
排版,审核:恺忻
今天给大家分享的是一篇GEO纯生信数据经典套路的文章,影响因子不高,但是文章中使用了较多的在线生信分析网站,对于生信初学者具有一定的参考价值。做的疾病是一种非肿瘤疾病——急性胰腺炎(acutepancreatitis),于年6月发表在DigestiveDiseasesandSciences,题为IdentificationofAcutePancreatitis-RelatedGenesandPathwaysbyIntegratedBioinformaticsAnalysis。
结果文章从GEO数据库下载了两个微阵列数据集GSE和GSE(鼠源性标本),作者使用了OmicShare和Morpheus在线工具绘制了火山图和热图,Venny在线工具绘制了差异基因的venn图。最终作者筛选出来了93个两数据集共有的差异表达的mRNAs(86个上调水平,7个下降水平)。
作者在DAVID工具中,对差异表达基因进行了功能注释和富集分析(GO和KEGG),其中GO分析的结果分为biologicalprocess,cellular