多种生物信息学分析方法联用确定急性胰腺炎

文章来源:重症胰腺炎   发布时间:2021-3-24 19:28:48   点击数:
 

作者:翼鸟風

排版,审核:恺忻

今天给大家分享的是一篇GEO纯生信数据经典套路的文章,影响因子不高,但是文章中使用了较多的在线生信分析网站,对于生信初学者具有一定的参考价值。做的疾病是一种非肿瘤疾病——急性胰腺炎(acutepancreatitis),于年6月发表在DigestiveDiseasesandSciences,题为IdentificationofAcutePancreatitis-RelatedGenesandPathwaysbyIntegratedBioinformaticsAnalysis。

结果

文章从GEO数据库下载了两个微阵列数据集GSE和GSE(鼠源性标本),作者使用了OmicShare和Morpheus在线工具绘制了火山图和热图,Venny在线工具绘制了差异基因的venn图。最终作者筛选出来了93个两数据集共有的差异表达的mRNAs(86个上调水平,7个下降水平)。

作者在DAVID工具中,对差异表达基因进行了功能注释和富集分析(GO和KEGG),其中GO分析的结果分为biologicalprocess,cellular

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