基于血浆和血清代谢组学的多变量预测模型的

文章来源:重症胰腺炎   发布时间:2021-11-3 15:05:19   点击数:
 

慢性胰腺炎(CP)是一种纤维化炎症性疾病,可导致器官功能障碍、慢性疼痛,增加胰腺癌风险及发病率。由于缺乏特异性生物标志物,目前CP的诊断主要依赖于患者症状及其影像学特征(不具敏感性),这妨碍了对CP的早期诊断和及时治疗。

本研究将名受试者分为三个群体,采用GC-MS结合LC-MS的技术来开展血液代谢物检测。首先通过发现集(IdentificationStudy)筛选出CP患者与对照组受试者中的血浆代谢标志物,随后在测试集(FirstValidationStudy)中对该生物标志物进行初步验证,最后通过验证集(SecondValidationStudy)评估了标志物在血清样本中的诊断效能。

代谢组检测结果

在发现集和测试集的血浆样本中检测到已知代谢产物个,未知代谢产物个;在验证集的血清样本中检测到已知代谢产物个,未知代谢产物个。物质分布情况如下图所示:

对所有血浆样本(IdentificationStudyFirstValidationStudy)数据进行PCA分析(图4A),发现CP与Control组存在较大重叠,仅在PC1(12%)主成分上有一定区分;而在验证集(SecondValidationStudy)中Control组与CP组和LC组均发生明显分离(图4B),猜想这可能是因为发现集与测试集中的Control组为非CP患者,而验证集中的Control组为健康人,健康人与CP患者间的代谢差异会更为显著。

训练集筛选到的biomarkerpanel,通过独立队列(Firstvalidationstudy)中例血浆样本进行测试,以评估其诊断性能。ROC分析得出AUC值为0.85(图4B),特异性为0.66,敏感性为0.84。

在第一个验证研究中,研究者测试了CP生物标志物在不同人群背景下依然有效,紧接着进行第二个验证研究(Secondvalidationstudy),在含有个受试者的队列中,研究者选择血清样本代谢数据进行验证,并将肝硬化患者作为额外的对照。ROC分析得出CP患者与对照组的AUC为0.87(图4C),特异性为0.89,敏感性为0.78,表明该生物标志物panel同样适用于血清样本。

参考文献:

AdamMG,BeyerG,ChristiansenN,KamlageB,PilarskyC,DistlerM,FahlbuschT,ChromikA,KleinF,BahraM,UhlW,GrützmannR,MahajanUM,WeissFU,MayerleJ,LerchMM.Identificationandvalidationofamultivariablepredictionmodelbasedonbloodplasmaandserummetabolomicsforthedistinctionofchronicpancreatitissubjectsfromnon-pancreasdiseasecontrolsubjects.Gut.Feb4:gutjnl--.doi:10./gutjnl--.

文献整理:杨琳娇

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